Theoretische und computergestützte Biophysik: Einführung (WS 2011/2012)


jeweils Montags, 16:00h, (HS3, Physik.) / CIP Computerraum

Hier finden Sie fortlaufend ergänzt Material und Hinweise zum Praktikum


Practical 1 : Introduction to Molecular Dynamics.

Practical 2 : Molecular Dynamics simulations of proteins.

Practical 3 : Protein structure determination by x-ray crystallography and NMR.

Practical 4 : Principal components analysis.

Practical 5 : Mechanism of water permeation and proton blocking in Aquaporins.

Practical 6 : Sequence retrieval, alignment and phylogenetic trees.

Practical 7 : Introduction to protein structure prediction.


Theoretische und computergestützte Biophysik 2: Einführung (WS 2011/2012)


Practical 8 : Free energy calculations.

Practical 9 : Rate theory.

Practical 10: Free Energies from non-equilibrium dynamics

Practical 11: Continuum Electrostatics Calculations



Lecture slides can be found here.


Bert de Groot / bgroot@gwdg.de Oct. 31, 2011